近日,黃海水產(chǎn)研究所與深圳華大基因研究院合作在魚類性反轉(zhuǎn)的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制研究上取得重要進(jìn)展,研究成果最近在國(guó)際著名期刊Genome Research (IF=14.4,2014.24: 604-615)上發(fā)表(http://genome.cshlp.org/content/24/4/604.short)。這是黃海所繼在Nature Genetics發(fā)表半滑舌鰨全基因組文章之后取得的又一重大研究成果。黃海所邵長(zhǎng)偉博士和華大基因研究院李啟業(yè)為該論文第一作者,黃海所陳松林研究員和華大基因張國(guó)捷博士為該論文通訊作者。
近幾年來,黃海所陳松林帶領(lǐng)其團(tuán)隊(duì)先后完成了半滑舌鰨全基因組精細(xì)圖譜的繪制以及高密度遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建。在此基礎(chǔ)上,他們瞄準(zhǔn)半滑舌鰨雌雄生長(zhǎng)差異巨大以及雌雄比例嚴(yán)重失調(diào)的生產(chǎn)實(shí)際,開展了半滑舌鰨正常雄魚(ZZ♂)、偽雄魚(p-ZW♂)、正常雌魚(p-ZW♀),以及偽雄魚和正常雌魚交配產(chǎn)生的F1 偽雄魚(f-ZW♂)和雌魚(f-ZW♀)性腺的全基因組DNA 甲基化測(cè)序,繪制了半滑舌鰨單堿基分辨率的全基因組甲基化圖譜。研究發(fā)現(xiàn)半滑舌鰨性逆轉(zhuǎn)的發(fā)生伴隨著性別決定和分化通路上相關(guān)基因甲基化狀態(tài)的改變,進(jìn)而深入解析了性逆轉(zhuǎn)后性染色體基因表達(dá)的劑量補(bǔ)償機(jī)制,發(fā)現(xiàn)半滑舌鰨偽雄魚性染色體缺乏整體劑量補(bǔ)償現(xiàn)象,但存在一個(gè)局部的劑量補(bǔ)償區(qū)域;同時(shí)研究發(fā)現(xiàn)F1 偽雄魚繼承了父本偽雄魚甲基化模式,從而首次發(fā)現(xiàn)了魚類性逆轉(zhuǎn)跨代遺傳現(xiàn)象。該研究成果為半滑舌鰨偽雄魚后代更容易性逆轉(zhuǎn)的現(xiàn)象提供了依據(jù),為魚類性逆轉(zhuǎn)機(jī)制的深入解析提供了新的思路,也為半滑舌鰨性別控制和高雌性化育種開辟了新的途徑。
該項(xiàng)研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目、國(guó)家863項(xiàng)目和公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)等項(xiàng)目的資助。
(基因組室 供稿)