近日,黃海水產研究所與深圳華大基因研究院合作在魚類性反轉的表觀遺傳調控機制研究上取得重要進展,研究成果最近在國際著名期刊Genome Research (IF=14.4,2014.24: 604-615)上發表(http://genome.cshlp.org/content/24/4/604.short)。這是黃海所繼在Nature Genetics發表半滑舌鰨全基因組文章之后取得的又一重大研究成果。黃海所邵長偉博士和華大基因研究院李啟業為該論文第一作者,黃海所陳松林研究員和華大基因張國捷博士為該論文通訊作者。
近幾年來,黃海所陳松林帶領其團隊先后完成了半滑舌鰨全基因組精細圖譜的繪制以及高密度遺傳連鎖圖譜的構建。在此基礎上,他們瞄準半滑舌鰨雌雄生長差異巨大以及雌雄比例嚴重失調的生產實際,開展了半滑舌鰨正常雄魚(ZZ♂)、偽雄魚(p-ZW♂)、正常雌魚(p-ZW♀),以及偽雄魚和正常雌魚交配產生的F1 偽雄魚(f-ZW♂)和雌魚(f-ZW♀)性腺的全基因組DNA 甲基化測序,繪制了半滑舌鰨單堿基分辨率的全基因組甲基化圖譜。研究發現半滑舌鰨性逆轉的發生伴隨著性別決定和分化通路上相關基因甲基化狀態的改變,進而深入解析了性逆轉后性染色體基因表達的劑量補償機制,發現半滑舌鰨偽雄魚性染色體缺乏整體劑量補償現象,但存在一個局部的劑量補償區域;同時研究發現F1 偽雄魚繼承了父本偽雄魚甲基化模式,從而首次發現了魚類性逆轉跨代遺傳現象。該研究成果為半滑舌鰨偽雄魚后代更容易性逆轉的現象提供了依據,為魚類性逆轉機制的深入解析提供了新的思路,也為半滑舌鰨性別控制和高雌性化育種開辟了新的途徑。
該項研究得到國家自然科學基金重點項目、國家863項目和公益性行業(農業)科研專項等項目的資助。
(基因組室 供稿)