近日，中國水產科學研究院黃海水產研究所陳松林研究員團隊聯合青島華大基因研究院、德國Wuerzburg大學等單位在斑石鯛Y染色體起源與進化研究中取得重要進展，研究成果在國際著名期刊Molecular Biology and Evolution（IF=11.062，doi:10.1093/molbev/msab056）在線發表。
斑石鯛是我國新興的重要海水養殖魚類，其味道鮮美，市場價值很高，深受消費者歡迎。斑石鯛具有復性染色體特征，其雌魚具有22對常染色體和 X1X1X2X2性染色體，而雄魚則具有22對常染色體和X1X2 Y性染色體，是研究魚類性染色體起源與進化的理想材料。該聯合研究團隊結合BGI-500、Nanopore、PacBio和Hi-C等技術，率先完成斑石鯛雌魚和雄魚染色體水平基因組精細圖譜繪制。利用三代和重測序數據獲得單倍型信息，將斑石鯛Y染色體非同源重組區進行精確組裝。結構分析表明Y染色體上存在一個約23.5 Mb的倒位，推測其在性別決定基因的產生和性染色體的進化過程中發揮重要作用。該研究推演了新Y（neo-Y）性染色體的起源與進化軌跡。進化分析表明，Y染色體上新融合進來的部分在融合后才產生重組抑制，推斷neo-Y的形成是原始的Y染色體與一條常染色體融合而來。同時該研究揭示了精巢和卵巢發育過程中性染色體基因的時空表達特征，鑒定了性染色體上性腺發育相關重要基因。斑石鯛neo-Y和X染色體的高質量組裝，為理解復性染色體魚類性別決定機制和性染色的進化提供了寶貴的遺傳資源。
黃海水產研究所博士后李明、青島華大基因研究院張睿和范廣益博士為該論文的第一作者，陳松林研究員、德國Wuerzburg大學M. Schartl教授和華大基因研究院劉心研究員為該論文的通訊作者。該項研究得到國家重點研發計劃藍色糧倉專項，中國水產科學研究院科技創新團隊專項及山東省泰山學者攀登計劃專家項目等資助。
論文鏈接：https://doi.org/10.1093/molbev/msab056
圖1：斑石鯛（Oplegnathus punctatus）
圖2：斑石鯛雌、雄個體染色體水平基因組組裝
圖3： 斑石鯛新Y染色體的進化模型
