中國水產科學研究院黃海水產研究所陳四清研究員團隊牽頭完成了綠鰭馬面鲀首個基因組精細圖譜的繪制工作，相關研究成果于5月10日在國際重要學術刊物Molecular Ecology Resources在線發表。
綠鰭馬面鲀俗稱“扒皮魚”、“耗兒魚”和“面包魚”，分布于渤海、黃海和東海，肉質鮮美，營養豐富，是我國沿海優良的經濟性魚類，自然資源匱乏，近年來，隨著規模化苗種繁育和養殖技術得到突破，養殖規模持續擴大。研究人員開展的綠鰭馬面鲀全基因組測序和組裝工作，可為遺傳背景解析、種質資源保護和遺傳育種提供支撐。
該研究工作結合納米孔測序技術（Nanopore）和染色體構象捕獲技術（Hi-C），組裝獲得474.31 Mb的基因組序列，共242個contig，contig N50為22.46 Mb，達到目前魚類基因組contig N50的最高水平。通過Hi-C將99.44%的組裝序列掛載到20個染色體上，預測獲得22067個編碼基因，67.35 Mb的重復序列。構建了基于1872個單拷貝基因的系統進化樹，并鑒定出67個綠鰭馬面鲀特有的基因家族。
綠鰭馬面鲀基因組精細圖譜的完成，為解析其生長、抗病等經濟性狀的分子機制，確定群體遺傳結構奠定了重要基礎。同時，高質量的精細圖譜為基因組學研究領域提供有價值的數據資源，有助于比較基因學相關研究的開展。
黃海水產研究所邊力、李鳳輝和葛建龍為論文共同第一作者；黃海水產研究所陳四清、邵長偉和青島市海洋科技成果推廣中心林治術研究員為本論文的共同通訊作者。該研究獲得了山東省重點研發計劃等項目的支持。
全文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.13183。
綠鰭馬面鲀
綠鰭馬面鲀與其他硬骨魚類的系統進化樹
