近日，Science China Life Sciences雜志在線發(fā)表了中國水產(chǎn)科學研究院黃海水產(chǎn)研究所陳松林院士團隊題為“Decoding fish genome starts new era of important traits study and molecular breeding in China”的綜述。該綜述總結(jié)了中國在魚類基因組研究和分子育種領(lǐng)域取得的重要進展，并對未來的研究方向進行了展望和探討。

水產(chǎn)養(yǎng)殖已成為全球農(nóng)業(yè)增長最快的領(lǐng)域，水產(chǎn)食品對保障世界糧食安全和營養(yǎng)做出了日益重要的貢獻。中國是世界第一水產(chǎn)養(yǎng)殖大國，魚類是水產(chǎn)養(yǎng)殖的支柱產(chǎn)業(yè)之一，然而種質(zhì)退化、病害頻發(fā)、生長緩慢等問題嚴重制約了魚類養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。

2014年1月，陳松林院士領(lǐng)銜一個國際合作團隊率先完成了重要海水養(yǎng)殖魚類——半滑舌鰨的全基因組測序和解析，論文在Nature Genetics發(fā)表，這不僅是我國發(fā)表的首個魚類基因組，也是世界上第一個比目魚類的基因組序列，實現(xiàn)了我國魚類基因組解析研究零的突破，標志著中國魚類及育種技術(shù)研究進入基因組時代。今年正值我國第一篇魚類基因組測序論文發(fā)表10周年，回顧總結(jié)10年來我國在魚類全基因組測序、重要性狀遺傳解析和分子育種技術(shù)建立與應用方面取得的重要進展和成果，對于推動魚類基因組育種技術(shù)的應用和種業(yè)發(fā)展具有重要意義。

截至2023年底，我國已完成并發(fā)表了60多種魚類的基因組測序和精細圖譜繪制論文，并基于這些基因組信息，開展了基因組進化、比較基因組學以及功能基因組學研究，發(fā)現(xiàn)了dmrt1等性別決定基因，解析了魚類生長發(fā)育、性別決定、抗病抗逆、變態(tài)、品質(zhì)等重要經(jīng)濟性狀的遺傳基礎(chǔ)，并在此基礎(chǔ)上，研制了“魚芯1號”等魚類抗病育種基因芯片，建立了基因組選擇和基因編輯育種技術(shù)，推動了魚類良種培育進程。

2014-2023年中國發(fā)表的魚類基因論文數(shù)目（圖中顯示每年發(fā)表的代表性物種）

該綜述總結(jié)了中國魚類全基因組精細圖譜繪制、重要性狀的組學分析和基因組育種技術(shù)的研究現(xiàn)狀、進展和未來發(fā)展方向，為水產(chǎn)研究學者、魚類育種學家和養(yǎng)殖從業(yè)人員提供了魚類基因組學研究和育種技術(shù)的綜合信息，有助于促進魚類重要經(jīng)濟性狀的遺傳選育和良種創(chuàng)制，支撐魚類養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。

該綜述第一作者為黃海所周茜研究員，通訊作者為陳松林院士。綜述的撰寫和發(fā)表得到了國家自然科學基金重點項目、國家農(nóng)業(yè)生物育種重大專項、山東省重點研發(fā)計劃等項目的支持。

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https://doi.org/10.1007/s11427-023-2670-5