日前,中國(guó)海洋大學(xué)海洋生物遺傳學(xué)與育種教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室包振民院士團(tuán)隊(duì)取得重要成果,在國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)領(lǐng)域頂級(jí)期刊《核酸研究》在線發(fā)表了國(guó)際首個(gè)軟體動(dòng)物綜合基因組數(shù)據(jù)庫(kù)。
隨著基因組學(xué)數(shù)據(jù)以史無(wú)前例的規(guī)模增長(zhǎng),深度挖掘復(fù)雜高維度的海量組學(xué)資源已成為當(dāng)前生命科學(xué)領(lǐng)域面臨的巨大挑戰(zhàn)。構(gòu)建系統(tǒng)便捷、功能全面的基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)在解決這一難題上發(fā)揮著重要作用。當(dāng)前,國(guó)際上廣泛使用的大型公共基因組數(shù)據(jù)庫(kù)仍主要聚焦并服務(wù)于人類(lèi)醫(yī)學(xué)及小鼠、斑馬魚(yú)、果蠅等模式生物研究。對(duì)非模式生物類(lèi)群(如大部分海洋生物)而言,至今缺乏適當(dāng)?shù)恼掀脚_(tái)及深度分析工具,以滿(mǎn)足日益增長(zhǎng)的對(duì)復(fù)雜海量組學(xué)數(shù)據(jù)的分析需求。
軟體動(dòng)物起源于5億年前早寒武紀(jì),是進(jìn)化最成功的無(wú)脊椎動(dòng)物群體之一。軟體動(dòng)物現(xiàn)存種類(lèi)高達(dá)10萬(wàn)種以上,是動(dòng)物界中僅次于節(jié)肢動(dòng)物的第二大門(mén)類(lèi)。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)廣泛收集軟體動(dòng)物基因組學(xué)資源,系統(tǒng)梳理整合多組學(xué)數(shù)據(jù)及開(kāi)發(fā)豐富的分析工具,構(gòu)建了迄今物種覆蓋度最廣、組學(xué)資源最豐富、功能最全面的軟體動(dòng)物基因組學(xué)分析平臺(tái)MolluscDB。