新的世紀，加強生態環境保護已成為全球共同面對的重大課題。我國社會經濟環境、發展方式和政策措施發生了重大變化，探索如何適應時代要求，深刻理解黨和國家的重大戰略部署，總結成功經驗，分析客觀形勢，把握有利時機，對于促進水生生物資源養護事業發展意義重大。
立足我國水生生物資源養護事業開啟的工作基礎
自2003年以來，國家漁業主管部門貫徹落實科學發展觀，制定水生生物保護規劃，認真研究國內外相關資料，分析養護工作面臨的形勢，積極探索，創新觀念，理清工作思路、目標、重點和對策措施創新，資源養護工作取得成效。經過幾年努力，全國水生生物資源養護取得了一系列歷史性突破和重大跨越，進入了全面、快速發展的新時期。
資源養護的重大活動營造了良好的社會氛圍。農業部與省級人民政府聯合舉辦了一系列水生生物資源養護重大活動，在社會上產生了良好反響。水生生物資源增殖等養護活動已遍及全國各省、自治區、直轄市的近岸海域及內陸江河湖庫等重要水域，各級地方政府和漁業主管部門舉行了豐富多樣的資源增殖活動。新聞媒體和社會各界高度關注、積極參與，形成了全國性的、社會影響廣泛的養護水生生物資源、改善生態環境的良好氛圍。
建立了國家級水產種質資源保護區，種質資源保護管理體系建設取得了歷史性突破。2007年，農業部首次公告《國家重點保護經濟水生動植物資源名錄》，確定保護物種166個，其中海洋捕撈產量100萬噸以上的帶魚以及10萬噸以上的其他16種魚類均被列入保護范圍；內陸養殖產量在200萬噸以上的草魚、鰱魚等5個魚類品種以及其他重要水產原種資源也被收入名錄中，為強化水產物種資源保護提供了重要的技術和法規依據。
探索建立了工程建設損害資源生態補償機制。依據相關法律法規和《中國水生生物資源養護行動綱要》（以下簡稱《行動綱要》），農業部逐步建立和規范了有關工程項目對漁業生態環境影響的評價機制，組織專家研究提出工程對漁業生態損害的評估方法，加強與相關部門和建設單位的協調，督促落實工程建設占用漁業資源的補償措施。
水生生物資源與漁業生態環境保護管理制度更加完善。多年組織實施的海洋伏季休漁制度得到進一步完善，休漁作業方式擴大、休漁時間延長。2003年起，經國務院同意，農業部組織實施了長江禁漁期制度。在組織全國漁業生態環境監測網絡單位開展監測的基礎上，農業部與環保部每年聯合向社會發布《中國漁業生態環境狀況公報》。此外，漁業污染事故調查處理制度更加完善，漁業系統每年處理漁業水域污染事故上千起，有效地維護了漁民權益。2008年4月，國家標準《漁業污染事故經濟損失計算方法》頒布。
資源增殖等養護行動取得了明顯的生態、經濟、社會效益。據統計，2003年～2008年全國共增殖苗種數量904.3億尾，年均增殖規模超過150億尾，遠多于2002年67.9億尾的增殖數量。增殖水域涵蓋了渤海、黃海、東海和南海的近岸海域，涵蓋了長江、珠江、黃河、黑龍江等重要江河，也涵蓋了洞庭湖、鄱陽湖、太湖等重要湖泊和水庫。增殖生物有大黃魚、中國對蝦、青、草、鰱、鳙、鯉、鯽、中華絨螯蟹等重要經濟物種，以及中華鱘、胭脂魚等瀕危物種。
經過跨越式發展，水生生物資源養護已由面向產業發展，拓展到面向經濟生態社會的全方位發展，更加彰顯了生態和社會效益，在建設資源節約、環境友好型社會和建設生態文明中發揮著越來越重要的作用。參與水生生物資源養護的社會范圍越來越廣、人員越來越多，充分體現了社會參與的廣泛性。
積極行動，加快發展水生生物資源養護事業
將水生生物資源養護作為社會公益事業發展，必須堅持以科學發展觀為統領，以《行動綱要》為指南，加大養護力度，落實各項措施。
要運用科學方法，統籌協調好水生生物資源養護6個方面的關系：
一是統籌協調資源養護與經濟社會發展全局的關系。既服從和服務于國家建設發展的大局，又通過經濟社會發展不斷增強水生生物資源的養護能力，做到保護中開發，開發中保護。
二是統籌協調全面保護與重點保護的關系。將水生生物資源養護工作納入國家生態文明建設的總體部署，對水生生物資源和水域生態環境進行整體性保護。同時，針對水生生物資源在水生生態系統中的主體地位和不同水生生物的特點，以資源養護為重點，實行多目標管理；在養護措施上，立足當前，著眼長遠，分階段、有步驟地加以實施。
三是統籌協調系統保護與分區保護的關系。根據資源的區域分布特征和養護工作面臨的任務，分區確定水生生物資源保護和合理利用的方向與措施。
四是統籌協調強化管理與服務漁民的關系。要立足當前與著眼長遠，兼顧各方面利益，妥善解決好漁民的生產發展和生活出路問題，維護好廣大漁民權益。
五是統籌協調政府主導與動員社會力量參與的關系。水生生物資源養護是一項社會公益事業，從水生生物資源的流動性和共有性特點考慮，必須充分發揮政府保護公共資源的主導作用。
六是統籌協調立足國情與采用國際先進經驗的關系。要負責任地履行我國政府簽署或參加的有關國際公約和規定的相應義務，學習借鑒國外先進的保護管理經驗。
