質量安全問題與水產品出口是否順暢緊密相連。2009年7月19日，由南方農村報舉辦的“羅非魚危機與產業整合”研討會上，記者了解到，雖然我國羅非魚出口并未發生嚴重質量安全問題，但養殖過程中的藥物殘留、加工過程中不規范使用添加劑的隱患依舊存在。而隨著GAA(全球水產養殖聯盟)制訂《羅非魚良好養殖規范》的即將出爐，對于我國出口羅非魚的質量要求將越來越高。
藥殘隱患依然存在
會上，廣東省出入境檢驗檢疫局食品監管處王偉表示，與其他水產品相比，羅非魚的抗逆抗病特性強，養殖用藥少，產品質量較為穩定。不過，因種苗生產、養殖過程、流通缺乏有效監管，我國的羅非魚仍存在一定的藥殘隱患。
據了解，2006年，廣東5家企業的5批羅非魚產品被美國、加拿大通報有孔雀石綠殘留。2008年，廣東4家企業的5批羅非魚產品被美、加通報有硝基呋喃和結晶紫殘留。今年以來，廣東又有1家企業的1批產品被美國通報結晶紫殘留。
除此外，為令魚片色澤更加明亮、外觀鮮美，我國許多加工企業在生產過程中使用發色技術亦是一大質量安全隱患。雖然美國允許這樣操作，但對方提出必須要做出標識。但因擔憂造成消費者心理恐慌，目前我國多數企業并未標識。
業界人士對此也深表擔憂，如果美國對此問題深究，加工廠會比較麻煩，因為他們畢竟沒有完全按照HACCP(危害分析與關鍵點控制)體系的要求進行組織生產，這有可能導致羅非魚出口的全面受阻。
羅非魚也需BAP認證
據媒體消息，2008年11月19日，美國衛生和公眾服務部部長萊維特在公開場合表示，為了確保食品的安全性，今后中國所有出口到美國的食品都需要經過獨立第三方的食品安全認證。最近幾年美國國內爆發多起食品安全問題，其中多數為進口食品。而目前，全球最大的零售商美國沃爾瑪公司及其他多家零售和餐飲企業已要求對蝦生產商必須滿足BAP標準。
據了解，BAP是GAA制定的水產養殖方面的最新規范標準，全稱為《最嚴謹養殖水產規范》。其主要內容是在全球范圍內檢驗水產品繁殖和養殖過程，及養殖場、加工廠的各項生產標準，由“從池塘到餐桌”的全產業鏈條角度，全面審核生產過程中的食品安全。
同是輸美的主要水產品，羅非魚也面臨BAP的考驗。上海海洋大學教授李思發表示，我國羅非魚產業是“外向為主，內向為輔”為特色的產業。他認為，國際上對產品質量的要求越來越高，各種認證愈顯必要，如GAA主持制訂的《羅非魚良好養殖規范》即將出爐。“未來，沃爾瑪超市必然要求羅非魚產品生產商必須滿足BAP標準，未經認證產品不得上架銷售。”李教授最后強調。
