1. 聚焦西部助力精準扶貧科技促進漁業增效增收
按照貫徹落實國家扶貧工作決策部署，中國水產科學研究院將扶貧工作列入院2016年度重點工作，并制定《院定點扶貧工作方案》，采用加強新型職業農民培訓、幫助編制漁業發展規劃、合作研究、援建養殖設施、派專職人員入駐幫扶等多種方式開展扶貧工作，加大科技對西部地區漁業幫扶力度。2016年度，在10個西部貧困地區舉辦科技服務50場次，派出專家400人次，發放技術資料1500余份，培訓和服務漁民3000人次；簽訂合作協議12個；派出4人分別到西藏、甘肅等有關地方政府或研究機構掛職，直接提供智力支持；助力新疆完成漁業規劃編制、工廠化繁育系統及養殖設施改造，推動云南省哈尼梯田大力發展“漁稻共作”，支撐國家級貧困縣——甘肅景泰縣完成6個示范區6000余畝池塘規劃建設，修復次生鹽堿地1.5萬余畝。通過漁業科技助力精準扶貧，促進了漁業轉型增效，帶動了地方經濟發展和漁民增收，為精準脫貧提供了重要抓手和有效路徑。
2. 打造深藍漁業創新平臺謀劃戰略性新產業發展
深藍漁業是面向深遠海域，集“養-捕-加”于一體的全產業鏈漁業生產新模式，是我國海洋漁業的戰略性新興產業。以協同開展深藍漁業科技創新，推動深藍漁業發展為目標，中國水產科學研究院攜手青島海洋科學與技術國家實驗室，整合全國優勢科研力量，成立“深藍漁業科技創新聯盟”，共建“深藍漁業工程裝備聯合實驗室”，共同打造深藍漁業科技創新平臺，全力推動我國深藍漁業發展。同時，結合農業部重點實驗室“十三五”布局，加強頂層設計，以“精捕大洋、深挖極地、優探過洋、拓展外?！睘榘l展思路，謀劃“農業部遠洋與極地創新學科群”并成功獲得農業部批準建設，由一個遠洋與極地漁業創新綜合性重點實驗室和大洋漁業、極地漁業、外海漁業、遠洋漁業裝備四個專業性重點實驗室組成，將成為我國深藍漁業科技創新的主力軍。
深藍漁業科技創新平臺的成功打造，將全面推動我國漁業向深遠海和極地海洋進軍，對維護國家海洋權益、保障優質蛋白供應、推動海洋戰略性新興產業發展具有深遠意義。
3. 繪制牙鲆全基因組精細圖譜闡釋比目魚變態發育機制
褐牙鲆等比目魚類的眼睛、體色等左右不對稱是非常獨特的現象，其作為達爾文發表《物種起源》以來爭論最為激烈的著名案例，一直受到科學界的高度關注。由中國水產科學研究院黃海水產研究所牽頭，針對褐牙鲆開展了高深度基因組測序、組裝和分析，繪制了褐牙鲆全基因組精細圖譜。通過對褐牙鲆和其他魚類全基因組的比較，發現了153個比目魚特異的基因家族、12個比目魚擴張的基因家族以及106個比目魚的正選擇基因并開展分析，發現其與細胞分裂和凋亡、眼睛大小調控、視網膜神經遞質、軟骨重構等比目魚變態過程中的生物學現象密切相關。實驗表明，光信號通路上的視蛋白在比目魚兩側皮膚上存在不同的表達模式，褐牙鲆眼睛的移動受到甲狀腺激素和視黃酸信號通路的拮抗調控，對于人類加深認識變態發育生物學具有重要意義。
該研究成果發表于《自然·遺傳》（NatureGenetics），為2014年以來中國水產科學研究院再次在國際知名學術期刊發表高水平論文，表明海水魚類基因組領域相關研究躋身世界先進行列。該研究為理解脊椎動物形態發育提供了新線索，對生產實踐中防止比目魚發生變態異常以及白化現象發生具有重要的指導意義。
4. 突破刀鱭全人工繁殖建立種質保護技術體系
針對長江刀鱭應激反應強烈、繁殖群體性腺發育不同步等關鍵問題，由中國水產科學研究院淡水漁業研究中心牽頭，通過開展長江刀鱭種質資源評估、原種保存和人工馴養等研究，分析了刀鱭性腺發育規律、繁殖生理特征和應激反應，突破了刀鱭的生理催熟、高效孵化、系列餌料、分級培育等關鍵技術，篩選出最適開口餌料，形成了刀鱭苗種生態培育技術，建立了苗種抗應激運輸技術；構建了“浮游動物+鯪魚魚苗+小蝦”套餐式生態養殖技術模式，實現了刀鱭大規格商品魚的人工養殖并進行產業化示范。同時，依托“長江珍稀魚類工程技術研究中心”和“江蘇省長江特色魚類協同創新中心”等平臺，構建了刀鱭資源監測評估體系。該研究成果獲“江蘇省科學技術一等獎”，為刀鱭種質資源養護和可持續利用提供重要的技術保障。
5. 研發哲羅魚高效飼料助推冷水魚產業化發展
針對養殖哲羅魚生長慢、餌料利用率低等制約產業發展的突出問題，中國水產科學研究院黑龍江水產研究所加強營養學基礎研究，闡明了哲羅魚對蛋白質等營養素的需要量，建立了營養參數基礎數據庫，研究分析了14種誘食劑對哲羅魚生長和免疫的作用，篩選出兩種適宜誘食劑。開發出不同生長階段的高效飼料，建立了人工飼料開口模式，提高了哲羅魚生長性能和免疫機能，減少了爛鰭、爛尾等癥狀；發現了仔稚魚攝食感覺器官在發育過程中及攝食強度時的對應關系。針對哲羅魚攝食節律確定了最適合的投喂時間，闡明了最適合的投喂頻率及投喂水平。開展了攝食模型研究，初步構建了哲羅魚精準投喂技術。該研究成果獲“黑龍江省科技進步二等獎”及“農業科學技術一等獎”，開發的飼料及添加劑系列新產品促進了哲羅魚生產成本有效降低，產生了顯著的經濟效益，為推動哲羅魚規模化養殖、促進冷水魚產業發展發揮了重要作用。
6. 完成怒江和瀾滄江生物資源調查推動重點流域資源保護
中國水產科學研究院長江水產研究所系統開展了西南重要河流——怒江、瀾滄江水生生物資源調查，查明了怒江和瀾滄江干流全江段及主要一級支流的大型底棲動物、水生植物的種類組成與分布情況，掌握了魚類的組成、分布、產卵場位置及部分種類的生長、繁殖特征及遺傳多樣性特征；評估了魚類的生存狀態和瀕危等級，提出了魚類保護物種建議名錄；形成了魚類資源保護對策、魚類保護規劃與魚類資源規劃；發明了裂腹魚類產卵場的人工建造方法；揭示了西雙版納熱帶雨林河流魚類棲息地選擇機制，并提出相應的保護措施；研究提出了怒江保護魚類名錄15種，瀾滄江保護魚類名錄39種；研究成果獲中國水產科學研究院科技進步一等獎，提出的怒江瀾滄江魚類保護建議名錄和保護措施，為漁業管理及決策部門落實生態補償措施、保護修復重要漁業資源和瀕危魚類棲息地提供了科技支撐，將對2017年啟動開展的覆蓋全流域、整合全要素的長江水生生物資源與環境調查具有重要參考意義。
7.系統布局海洋牧場研究促進漁業資源養護修復
建設海洋牧場是我國養護海洋漁業資源、改善海洋生態環境、振興海洋漁業的戰略舉措。配合主管部門，中國水產科學研究院南海水產研究所牽頭，啟動開展了海洋牧場發展戰略研究，編制了《國家級海洋牧場示范區建設規劃》，研究提出我國海洋牧場內涵、類別、區域布局和中長期發展思路、重點任務；推進海洋牧場標準體系建設研究，參與《海洋牧場管理辦法》編制，為我國海洋牧場標準化建設和規范化管理提供有效依據；創建了適合我國不同海區的人工魚礁、海藻場和底棲動物棲息生境優化構建技術，研發了海洋牧場生境—容量—品種—牧化—利用的生態增殖與開發新技術，推動形成了海洋牧場與休閑漁業結合開發利用的新模式，通過技術集成與模式應用，有效促進了我國近海生物資源養護與生態環境修復。
8. 突破南極磷蝦捕撈加工裝備有效提升極地漁業經濟效益
針對捕撈網具依賴進口、加工技術落后等制約南極磷蝦產業發展的重點問題，中國水產科學研究院東海水產研究所自主研制了南極磷蝦拖網網具（BAD13B00-TN02型）及配套水平擴張裝置，漁獲效率達到0.5噸~0.9噸/分鐘，網次最大產量達40噸，拖網能耗系數為0.686千牛/平方米，優于同船使用的挪威進口拖網，水平擴張裝置升阻比達到5.8，各項性能均優于相似面積的進口空心網板，可完全替代進口網具；中國水產科學研究院漁業機械儀器研究所成功研發了多層往復式南極磷蝦脫殼設備，集成混合勻料、分水布料、成品輸送、除雜分揀、自動控制等輔助設備，建立了船載南極磷蝦脫殼加工生產線并進行了實船生產性試驗，處理能力≥1000公斤/小時，蝦仁得肉率≥20%，蝦殼殘留率≤10%。以上國產化捕撈加工裝備的研發及生產應用，有力推動了我國南極磷蝦產業裝備水平的跨越提升，將為產業規?；行虬l展提供重要支撐。
9. 高海況打撈設備全面升級促進軍民融合創新發展
圍繞應急救援保障任務和日常救助工作有效轉換的需求，中國水產科學研究院漁業機械儀器研究所針對原返回艙打撈設備拆裝周期過長、無法滿足平戰結合的問題，開展了高海況打撈關鍵技術及相關打撈設備系統升級研究。集成電液控制及波浪補償技術，創新設計了救助船在高海況條件下對救助打撈返回艙的船側攔截、打撈、起吊一體化的新方法，創制基于主被動復合波浪補償控制技術的新型高海況打撈設備系統，完成了3艘專業救助船的加改裝任務，經過打撈試驗、訓練演練和“SZ-11”實戰任務檢驗，證明了方案合理可行、系統先進實用、設備安全可靠，得到了解放軍戰略支援部隊和交通運輸部相關領導的高度肯定，標志著海洋工程裝備領域的重要技術突破，該系統滿足“平戰結合”的要求，對提升救助船舶裝備水平、實現軍民融合發展具有重要意義。
中國水產科學研究院先后完成了“神舟四號”至“神舟十號”飛船發射的海上應急救援保障，并在2016年再次圓滿執行了“神舟十一號”飛船上升段海上應急救援保障任務，有效履行了中國載人航天事業賦予的光榮使命。
10.豐富優化養殖品種結構新品種培育再結碩果
中國水產科學研究采用傳統和現代結合育種技術，在新品種創制方面取得新成果，牽頭培育的四倍體異育銀鯽“長豐鯽”、莫荷羅非魚“廣福1號”、合浦珠母貝“南珍1號”等3個新品種以及與其他單位合作培育的白金豐產鯽通過全國水產原種和良種審定委員會審定。在相同養殖條件下，長豐鯽與普通銀鯽相比，1齡魚和2齡魚生長速度分別提高25.0%以上和16.0%以上；“廣福1號”為耐鹽新品種，可在鹽度0~30的水域中正常生長，與普通雜交羅非魚（橙色莫桑比克羅非魚♀×荷那龍羅非魚♂）相比，6月齡魚生長速度提高19.0%以上；“南珍1號”與未經選育的合浦珠母貝相比，1齡貝平均殼高和體重分別提高10.0%以上和25.0%以上，插核8個月的育珠貝留核率達50.0%以上，優珠率達60.0%以上。多個新品種的成功創制與推廣養殖，將有效助推我國現代水產種業的健康持續發展。
