日前，植物學(xué)知名期刊Frontiers in Plant Science在線發(fā)表了黃海水產(chǎn)研究所藻類種質(zhì)資源與功能團(tuán)隊(duì)題為“Identification of Genes under Positive Selection Reveals Differences in Evolutionary Adaptation between Brown-Algal Species”的最新研究成果。該團(tuán)隊(duì)與英國(guó)東安格利亞大學(xué)的Thomas Mock教授開(kāi)展了合作研究，通過(guò)全基因組水平正選擇基因的鑒定與分析，發(fā)現(xiàn)了海帶與水云在適應(yīng)性進(jìn)化歷程中起到關(guān)鍵作用的基因，從正選擇角度揭示了大型褐藻的形成與進(jìn)化機(jī)制。黃海所博士后滕林宏為該論文的第一作者。

該研究以褐藻中的模式物種水云和有參考基因組的海帶為研究對(duì)象，采用雙向最佳比對(duì)明確了同源基因；根據(jù)編碼基因密碼子中同義替換與非同義替換的比率，鑒定出水云和海帶中分別受到正選擇壓力作用的基因；通過(guò)對(duì)目標(biāo)基因進(jìn)行功能注釋和分類，明確了其參與的生物學(xué)過(guò)程；結(jié)合組學(xué)數(shù)據(jù)分析，解析了各種環(huán)境條件下及不同世代藻體中正選擇基因的作用機(jī)制。研究結(jié)果為全面揭示褐藻的進(jìn)化歷程和適應(yīng)機(jī)制提供了理論依據(jù)和數(shù)據(jù)支持。

該研究得到了現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位專家、青島海洋科學(xué)與技術(shù)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室“鰲山人才”優(yōu)秀青年學(xué)者、山東省杰出青年科學(xué)基金和青島市創(chuàng)業(yè)領(lǐng)軍人才計(jì)劃等項(xiàng)目的資助。

海帶正選擇基因在不同世代中的表達(dá)水平