7月18-19日，根據《農業部關于開展2011年農業建設項目專項檢查工作的通知》要求，農業部發展計劃司建設項目監管處組織有關基本建設項目管理、工程、技術、基建財務等方面的專家，對黃海所2006年以來承擔的基本建設項目進行了專項檢查，對已經通過竣工驗收的“海水鲆鰈魚類遺傳育種中心建設項目”進行了抽查，對正在執行的“黃渤海漁業資源環境重點野外科學觀測試驗站建設項目”進行了重點檢查。

檢查組在聽取了殷邦忠副所長對黃海所基本建設項目總體執行情況和管理情況匯報后，對正在執行的項目對照批復內容進行了實地考察，逐項檢查，全面查閱了工程檔案和財務賬目以及其他有關資料，并對有關問題進行了質詢。

檢查后，農業部發展計劃司建設項目監管處處長、檢查組組長孫榮對檢查工作進行了總結，對黃海所基本建設項目的執行和管理情況給予了充分肯定和高度評價。檢查組認為：建設項目實施內容與批復的項目可行性研究報告和初步設計內容基本一致，項目建設進度和質量符合實施方案要求；資金管理規范，專賬核算、專人管理、專款專用；項目嚴格執行了“四制”，制度建設完善，組織機構完整，工程檔案資料齊全，管理規范，尤其在招投標、內控監督等方面具有較高的科學創新性。同時，檢查組希望黃海所認真總結基本建設管理經驗，進一步加快項目建設進度，為今后建設項目的實施奠定堅實基礎。

水科院基建條件處處長趙紅萍在致辭中感謝農業部發展計劃司對黃海所承擔建設項目的大力支持，并表示，黃海所將以此次檢查為契機，總結經驗，查找不足，更好地規范項目管理，推進項目更好更快建設。

近年來，黃海所基本建設項目的順利實施提升了本所科研基礎條件水平，促進了科技創新能力的提高，增強了行業競爭力。