近日，由中國水產(chǎn)科學研究院黃海水產(chǎn)研究所紀曉峰等研究發(fā)明的“一種電壓-門控鈉離子通道的結構預測方法”獲國家發(fā)明專利授權，專利號2017105453919。
本發(fā)明公開了一種適用于電壓?門控鈉離子通道的結構預測的方法，具體涉及一種基于模板構建真核電壓?門控鈉離子通道Nav1.5孔道結構域開放態(tài)的結構模建方法。首先通過rosetta的膜蛋白同源模建方法，以獲得晶體三極結構的細菌鈉離子通道模板，初步構建組成Nav1.5孔道結構域的四個亞基結構；然后根據(jù)各個構建模型的打分情況進行排序，挑選得分最高的結構作為各個結構域的初始結構；然后將構建完成的四個亞基結構分別比對到4CBC的四個亞基上，并對組裝完成的整體結構進行優(yōu)化；以已有局部麻醉劑類藥物的結構數(shù)據(jù)和試驗數(shù)據(jù)為基礎，與優(yōu)化完的結構進行分子對接，根據(jù)已有實驗結果設定篩選和評價策略，確定構建模型的可靠性。
