1.劉慧，黃小平，王元磊，梁洲瑞，古彬，蘇紀(jì)蘭，2016. 渤海曹妃甸新發(fā)現(xiàn)的海草床及其生態(tài)特征。生態(tài)學(xué)雜志，35（7）：1677-1683

2.劉慧，2016. 中國(guó)漁業(yè)水產(chǎn)學(xué)科發(fā)展戰(zhàn)略。[王穎等] 中國(guó)學(xué)科發(fā)展戰(zhàn)略 ? 海岸海洋科學(xué)?？茖W(xué)出版社，北京.

3.Liu H, Chang YQ, 2015. Sea urchin aquaculture in China. In: Brown NP, and Eddy SD [eds.]. Wiley Blackwell. pp368

4.唐啟升，劉慧，方建光，張繼紅，2015. 海洋生物碳匯擴(kuò)增。[中國(guó)工程院生物碳匯擴(kuò)增戰(zhàn)略研究課題組] 生物碳匯擴(kuò)增戰(zhàn)略研究。科學(xué)出版社，北京。pp187

5.Liu H, Su JL, 2015. Vulnerability of China’s nearshore ecosystems under intensive mariculture development. Environ Sci Pollut Res. DOI 10.1007/s11356-015-5239-3

6.Su JL, Liu H, 2014. China’s approach to marine eco-aquaculture. Proceedings of International Conference on Eco-aquaculture and Public Health. Hong Kong. p18 (pp126)

7.朱建新，劉慧，徐勇，陳世波，劉圣聰，張濤，曲克明，2014. 循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)生物濾器負(fù)荷掛膜技術(shù)研究。漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展，35（4）118-124

8.劉慧，方建光，2014. 大規(guī)模海水養(yǎng)殖的生態(tài)影響。[蘇紀(jì)蘭等] 中國(guó)海洋與海岸工程生態(tài)安全中若干科學(xué)問題及對(duì)策建議?？茖W(xué)出版社，北京.

9.Wang W., Liu H., Li Y.Q., Su J.L., 2014. Development and management of land reclamation in China. Ocean and Coastal Management, 102: 415-425 (co-first author)

10.劉慧, 蘇紀(jì)蘭, 2014. 基于生態(tài)系統(tǒng)的海洋管理理論與實(shí)踐。地球科學(xué)進(jìn)展, 29(2): 275-284

11.國(guó)合會(huì)課題組. 2013. 中國(guó)海洋可持續(xù)發(fā)展的生態(tài)環(huán)境問題與政策研究。中國(guó)環(huán)境出版社，北京。pp 493

12.王清印，桂建芳，李家樂，鄒桂偉，江世貴，包振民，魏寶振，劉慧，2013. 水產(chǎn)遺傳育種與種子工程發(fā)展戰(zhàn)略研究。中國(guó)養(yǎng)殖業(yè)可持續(xù)發(fā)展戰(zhàn)略研究——水產(chǎn)養(yǎng)殖卷（中國(guó)工程院重大咨詢項(xiàng)目，中國(guó)養(yǎng)殖業(yè)可持續(xù)發(fā)展戰(zhàn)略研究項(xiàng)目組）。中國(guó)農(nóng)業(yè)出版社，北京。pp67-105

13.陳世波，劉慧，朱建新，2013. 溫度調(diào)控對(duì)刺參夏眠期生長(zhǎng)和體壁成分的影響。漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展，34（6）100-106

14.高春燕，劉慧，張婷婷，2013. 海帶發(fā)酵產(chǎn)甲烷的初步研究。可再生能源，10:109-114（通訊作者）

15.張婷婷，劉慧，葉乃好，2013. 顆粒大小和幾種預(yù)處理方法對(duì)滸苔厭氧發(fā)酵產(chǎn)沼氣的影響。上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào)，22（5）：784-788（通訊作者）

16.陳世波，劉慧，朱建新，2013. 刺參夏眠及其工廠化養(yǎng)殖調(diào)控技術(shù)。漁業(yè)現(xiàn)代化，40（2）：33-38（通訊作者）

17.王清印，劉慧，2013. 我國(guó)水產(chǎn)種業(yè)發(fā)展述評(píng)。（王清印等編著）《水產(chǎn)生物育種的理論與實(shí)踐》，科學(xué)出版社，北京

18.呂為群，陳阿琴，劉慧，2012. 魚類腸道的碳酸鹽結(jié)晶物: 海水魚類養(yǎng)殖在碳匯漁業(yè)中的地位和作用。水產(chǎn)學(xué)報(bào)，36（12）：1924-1932

19.王清印，劉慧，2012. 水產(chǎn)遺傳育種領(lǐng)域研究進(jìn)展。中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)發(fā)展報(bào)告（2006-2010）（主編：張顯良等），中國(guó)農(nóng)業(yè)出版社，北京。pp104-120

20.劉慧，唐啟升，2011. 國(guó)際海洋生物碳匯研究進(jìn)展。中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)，18（3）695-702

21.高春燕，劉慧，葉乃好，李曉川，2011. 大型海藻發(fā)酵生產(chǎn)甲烷技術(shù)研究。中外能源，16（4）27-35（通訊作者）

22.郭娜，董雙林，劉慧，2011. 幾種飼料原料對(duì)刺參幼參生長(zhǎng)和體成分的影響。漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展，32（1）122-126（通訊作者）

23.李萱，曾曉明(通訊作者)*.2011.《中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)》2010年文獻(xiàn)計(jì)量分析.農(nóng)業(yè)圖書情報(bào)學(xué)刊.（10）

24.李萱,曾曉明*.淺談圖書館中文文獻(xiàn)信息資源的建設(shè)與服務(wù).中國(guó)科技博覽,2013,(34):244

25.馮曉霞,曾曉明*.2001-2011年黃海所中文科技論文產(chǎn)出分析.中國(guó)科技成果,2013,(17):22-23

26.李萱,曾曉明*.圖書館外文文獻(xiàn)信息資源的建設(shè)與服務(wù).中國(guó)科教創(chuàng)新導(dǎo)刊,2013,(32):270

27.曾曉明,馮曉霞*.從SCI論文看研究所的創(chuàng)新能力.中國(guó)科教創(chuàng)新導(dǎo)刊,2013,(34):25-26

28.王建坤 劉世祿。我國(guó)海水魚類養(yǎng)殖發(fā)展現(xiàn)狀與展望。海水養(yǎng)殖科技創(chuàng)新與發(fā)展，北京：海洋出版社，2013：p33-42.

29.王清印 劉世祿 王建坤。關(guān)于切實(shí)維護(hù)我國(guó)南海漁業(yè)權(quán)益的研究。 漁業(yè)信息與戰(zhàn)略，2012，(1)，12-17。

30.劉世祿，王建坤。關(guān)于加快發(fā)展我國(guó)海水養(yǎng)殖業(yè)的戰(zhàn)略思考。海水養(yǎng)殖與碳匯漁業(yè)，北京：海洋出版社，2012：p1-8。

31.劉世祿，王建坤。世界水產(chǎn)養(yǎng)殖發(fā)展現(xiàn)狀與趨勢(shì)。多營(yíng)養(yǎng)層次的海水綜合養(yǎng)殖，北京：海洋出版社，2011：p1-7。

32.王清印，賈曉平，劉世祿，王建坤，陳作志。南海漁業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略研究，2011。

33.唐啟升，劉世祿，王建坤等。浙江沿海及海島生態(tài)保育研究，2012

34.Ma C, Gao Q, Liang Y, Li C, Liu C, Huang J. Shrimp arginine kinase is a binding protein of WSSV envelope protein VP31. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2015. DOI: 10.1007/s00343-016-5198-7

35.陳嚴(yán)，2013. 2010-2011年《漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展》退稿原因分析及對(duì)策?？萍夹畔?2:443-444.

36.陳嚴(yán)，2011. 2004-2008年《海洋水產(chǎn)研究》研究生論文引文分析。農(nóng)業(yè)圖書情報(bào)學(xué)刊，23（7），81-85

37.陳嚴(yán)，2011. 2004～2008年《海洋水產(chǎn)研究》研究生論文質(zhì)量分析。農(nóng)業(yè)圖書情報(bào)學(xué)刊，23（2），78-81

38.劉世祿, 馮小花, 陳輝. 關(guān)于加快發(fā)展我國(guó)遠(yuǎn)洋漁業(yè)的戰(zhàn)略思考. 漁業(yè)現(xiàn)代化, 2014, 41(4) : 63?67

39.劉世祿, 馮小花, 陳輝. 世界海水養(yǎng)殖現(xiàn)狀、發(fā)展趨勢(shì)與特點(diǎn). 科技創(chuàng)新與健康養(yǎng)殖, 2014, 1?8

40.孫龍啟, 劉世祿, 王建坤. 關(guān)于加快發(fā)展我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖傳感器的戰(zhàn)略思考[A]. 中國(guó)水產(chǎn)學(xué)會(huì)海水養(yǎng)殖分會(huì)2015年全國(guó)海水養(yǎng)殖學(xué)術(shù)研討會(huì). 廣州, 2015.

41.孫龍啟, 林元燒, 陳俐驍, 曹文清, 鄭連明. 北部灣北部生態(tài)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)與功能研究VII: 基于Ecopath模型的營(yíng)養(yǎng)結(jié)構(gòu)和關(guān)鍵種篩選[J]. 熱帶海洋學(xué)報(bào).